Элдиёр Тошматов окончил Университет мировой экономики и дипломатии, Академию государственного и общественного строительства при президенте и Университет Вебстера в Ташкенте.
Трудовую деятельность начал в Министерстве внешних экономических связей (ныне Министерство инвестиций, промышленности и торговли). С 2008 года служит в системе МИД, прошёл карьерный путь от атташе до советника в постоянном представительстве Узбекистана в Женеве.
В 2017—2019 годах был помощником министра иностранных дел, начальником его секретариата и главой Организационно-контрольного управления МИДа. Секретариатом председателя Сената руководил с 2022 года.
На этом посту Элдиёр Тошматов сменил Улугбека Лапасова, который с августа 2023 года возглавляет Постоянное представительство Узбекистана при ООН в Нью-Йорке.
